赵碧海

发布时间:2019-05-31 责任编辑:中卓1 

说明: 赵碧海2寸照.jpg赵碧海, 工学博士, 副教授,硕士生导师,湖南省青年骨干教师。主要研究方向为:生物信息学,数据挖掘等。在蛋白质复合物预测、关键蛋白质识别、蛋白质功能预成等方面开展了一系列研究。主持国家自然科学基金面上项目1项,湖南省自然科学基金2项,湖南省教育厅项目2项,长沙市科技项目2项,获计算机软件著作登记权8项,在《IEEE/ACM Transactions on computational Biology and Bioinformatics》、《BMC Bioinformatics》、《Methods》、《自动化学报》等国内外学术期刊发表学术论文30余篇,其中SCI检索14篇, EI检索8篇。 



学习经历

2009/09-2014/12,中南大学,信息科学与工程学院,博士

2002/09-2005/06,中南大学,信息科学与工程学院,硕士

1998/09-2002/07,湖南科技大学,计算机科学与工程学院,学士

 

工作经历

2005/09-至今,长沙学院,计算机工程与应用数学学院,副教授

 

期刊论文

[1] Bihai Zhao, Jianxin Wang, Fang-Xiang Wu and Yi Pan: Construction of Uncertain Protein-Protein Interaction Networks and Its Applications, 9th International Symposium, ISBRA 2013, Charlotte, NC, USA, May 20-22, 2013. EI

[2] Bihai Zhao, Jianxin Wang, Mi Li, Fang-Xiang Wu and Yi Pan. Detecting Protein Complexes Based on Uncertain Graph Model. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2014, 11(3):486-497. SCI

[3] Bihai Zhao, Jianxin Wang, Mi Li, Fang-Xiang Wu and Yi Pan. Prediction of essential proteins based on overlapping essential modules. IEEE Transactions on NanoBioscience, 2014, 13(4): 415-424. SCI

[4] 赵碧海,熊慧军,倪问尹,刘志兵,胡赛,一种改进的基于加权网络的蛋白质复合物识别算法,计算机科学,2014,41(6):231-234.

[5] Bihai Zhao, Jianxin Wang, Fang-Xiang Wu and Yi Pan. Predicting Protein Functions Based on Dynamic Protein Interaction Networks, 11th International Symposium, ISBRA 2015 Norfolk, USA, June 7-10, 2015. EI

[6] Bihai Zhao, Jianxin Wang, Mi Li, Fang-Xiang Wu and Yi Pan. A New Method for Predicting Protein Functions From Dynamic Weighted Interactome Networks. IEEE Transactions on NanoBioscience, 2016,15(2):131-139. SCI

[7] Bihai Zhao, Jianxin Wang, Xueyong Li and Fang-Xiang Wu. Essential Protein Discovery based on a Combination of modularity and conservatism. Methods. 2016, 110: 54-63. SCI

[8] 胡赛,熊慧军,陈治平,赵碧海(*),基于不确定网络的关键蛋白质识别,四川大学学报(工程科学版),2014,46(05):116-120. EI

[9] 胡赛,熊慧军,赵碧海(*),李学勇,王晶,动态加权蛋白质相互作用网络构建及其应用研究,自动化学报,2015,41(11):1893-1900. EI

[10] 胡赛,熊慧军,李学勇,赵碧海(*),倪问尹,杨品红,刘臻,多关系蛋白质网络构建及其应用研究,自动化学报,2015,41(12):2155-2163. EI

[11] Xiaoxia ZHANG, Qianghua XIAO,Bin LI, Sai Hu, Huijun XIONG, Bihai ZHAO(*), Overlap maximum matching ratio (OMMR): a new measure to evaluate overlaps of essential modules, Frontiers of Information Technology & Electronic Engineering,2015,16(4):293-300. SCI

[12] Xueyong Li, Jianxin Wang, Bihai Zhao(*), Fang-xiang Wu, Yi Pan. Identification of protein complexes from multi-relationship protein interaction networks, Human Genomics, 2016, 10(2): 17. SCI

[13] Zhao B, Hu S, Li X, et al. An efficient method for protein function annotation based on multilayer protein networks. Human Genomics, 2016, 10(1): 33. SCI

[14] Pan Y, Hu S, Zhao B(*). Identification of Essential Protein based on Functional Modules and Weighted Protein-Protein Interaction Networks. International Journal of u- and e- Service, Science and Technology, 2016, 9(8): 343-350 EI

[15] 潘怡,胡赛,赵碧海(*), 加权优先级网络在蛋白质功能预测中的应用研究. 小型微型计算机系统,2017,38(9):1977-1982.

[16] 倪问尹,王建新,熊慧军,赵碧海,胡赛(*),基于不确定数据的功能模块预测,四川大学学报(工程科学版),2013,45(05):80-87. EI

[17] Wenyin NI ,Huijun XIONG, Bihai ZHAO, Sai Hu(*), Predicting overlapping protein complexes in weighted interactome networks,Journal of Zhejiang University-Science C (Computers and Electronics), 2013, 14(10): 756-765. SCI

[18] Wei Peng, Jianxin Wang, Bihai Zhao, Lusheng Wang. Identification of protein complexes using weighted PageRank-Nibble algorithm and core-attachment structure. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2015, 12(1): 179-192. SCI

[19] 赵碧海,李学勇,胡赛(*),张帆,田清龙,杨品红,刘臻. 基于关键功能模块挖掘的蛋白质功能预测研究. 自动化学报, 201844(1):183-192.

[20] Bihai Zhao, Jianxin Wang, Fang-Xiang Wu. Computational Methods to predict protein functions from protein-protein interaction networks. Current Protein & Peptide Science, 2017, 18(11): 1120-1131.

[21] Xiwei Tang, Xueyong Li, Sai Hu, Bihai Zhao(*). A framework for identifying functional modules in dynamic networks. Int. J. Data Mining and Bioinformatics, Vol. 21, No. 1, 2018

[22] Bihai Zhao, Yulin Zhao Y, Xiaoxia Zhang, et al. An iteration method for identifying yeast essential proteins from heterogeneous network. BMC Bioinformatics, 2019, 20(1): 355.

[23] Bihai Zhao, Sai Hu, Zhihong Zhang, et al. Hyperlink induced topic search-based method to predict essential proteins. International Journal of Data Mining and Bioinformatics, 2019, 22(3): 250-264.

 

科研项目

[1] 国家自然科学基金面上项目,61772089,基于多维生物模型的蛋白质功能预测研究,2018/01-2021/1264万元,在研,主持

[2] 湖南省自然科学基金面上项目,2019JJ40049,基于张量分解的蛋白质功能预测算法研究,2019/01-2021/1210万元,在研,主持

[3] 湖南省自然科学基金青年项目,2016JJ3016,基于多关系网络的蛋白质功能预测方法及应用研究,2019/01-2021/125万元,已结题,主持

[4] 湖南省教育厅重点项目,16A020,基于马尔可夫链的蛋白质功能预测算法研究,2016/06-2018/066万元,已结题,主持

[5] 长沙市科技局一般项目,ZD1601021,基于物联网的低温奶自助零售链智能监管系统开发,2016/06-2018/068万元,已结题,主持

[6] 长沙市科技局一般项目,K1205049-11,基于物联网的自动售货机远程智能监控平台研究,2012/09-2014/098万元,已结题,主持

[7] 湖南省教育厅一般项目,14C0096,基于不确定性网络的关键蛋白质识别研究,2014/06-2015/061万元,已结题,主持

[8] 湖南省教育科学规划课题,XJK016BGD078,基于计算思维的大学计算机基础MOOC课程教学模式研究,2016/05-2018/051万元,已结题,主持

 

出版专著

[1] 多元蛋白质相互作用网络研究. 北京邮电大学出版社,2018

[2] 基于网络重构的功能模块挖掘及应用研究. 湖南科学技术出版社, 2019

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